Характерные детали внутреннего строения корок выявляются при микроскопическом и электронномикроскопическом изучении этих образований. Такое изучение показывает, что рудным коркам в основном свойственно глобулярное, глобулярно-зернистое, глобулярно-блоковое, колломорфное и колломорфно-глобулярное, колломорфно-кавернозное и колломорфно-ячеистое строение

Общая схема эволюции рудного процесса в пределах Магеллановых гор в целом однотипна для всех вулканических сооружений.

Все слои имеют четкие резкие границы, нередко обладают признаками несогласия — наличием эрозионных поверхностей, выпадением из разреза отдельных прослоев. Эти явления фиксируют перерывы в накоплении рудного вещества.

В ряде случаев (почти в 25) наблюдаются корки «неполного разреза». Часто отсутствует «базальный» слой R, на субстрате образуется сразу II слой, на котором лежит III, или постфосфатный. По-видимому, такие корки начали формироваться позже обычных; наиболее широко они развиты на глубинах 2,5—3,0 км.

Слой 1—1 толщиной 2—7 см сложен интенсивно преобразованным рудным веществом компактно-слоистой (I—1а) и грубопараллельно-слоистой (1—1 в) текстур. Основные минералы — железистый вернадит, марганцевый ферроксигит, апатит; отмечается примесь асболана, асболан-бузерита.

Работы последних лет позволили уточнить и детализировать обобщенный разрез железомарганцевых корок Магеллановых гор Тихого океана. По данным М. Мельникова (1994), выделено пять слоев, прослеживающихся на всех гайотах района .

В большинстве случаев корки Тихого океана имеют отчетливо выраженное слоистое строение, при этом независимо от региона, как правило, выделяются три слоя (Богданов и др., 1991).

Структура поверхности корок неоднородная и может быть гладкой, шероховатой (шагреневой), бугорчатой и мелкобугорчатой (ботриоидальной) с выступающими пизолитами.