В наиболее изученных районах Индийского океана (поднятия Кокосовой котловины, хр. Инвестигейтор и др.) корки встречаются преимущественно на базальтоидах, вариолитах и литифицированных осадочных образованиях, сложенных преимущественно скелетами фораминифер.

Таким образом, в качестве субстрата рудных корок может выступать любая твердая горная порода независимо от ее генезиса.Связь интенсивности рудонакопления с составом субстрата проявлена не слишком отчетливо, но тем не менее существует: на рифогенных известняках наблюдаются только тонкие корки или примазки рудного вещества, на кремнях — маломощные корки, а на базальтах и брекчиях — наиболее мощные (до 13—15 см). На участках дна, где залегают рыхлые осадки, имеются только маломощные корки, нередко ассоциирующиеся с конкрециями, ядра которых состоят из обломков базальтов и гравелитов.

Железомарганцевые корки представляют собой протяженные покровы гидрооксидов железа и марганца на скальных выступах вулканогенных и осадочных пород, а также плитах и глыбах элювия, которые могут быть полностью заключены в рудную оболочку. Помимо этого, в районах развития корок встречаются отторженные корковые плиты, корково-конкреционные образования и конкреции. Весь этот материал закономерно размещен на склонах — от вершин гор до их подножий.