Модификацией хемогенной гипотезы можно считать метасоматическую модель, предусматривающую образование фосфоритов в результате фосфатизации карбонатов при контакте с морской водой, обогащенной фосфором.

Согласно вулканогенной гипотезе Н. Шатского, формирование крупных залежей фосфоритов связано с поступлением в океан больших масс фосфора при вулканических извержениях. После миграции на значительные расстояния в составе водных масс фосфор концентрируется на дне.

Обобщая данные 1950—1960-х годов по геохимии фосфора в океане, Г. Бушинский выдвинул биохимическую гипотезу, основное

отличие которой от биолитной и микробиологической заключалось в том, что главная роль в первичной концентрации и осаждении фосфора отводилась не ихтиофауне и не микроорганизмам, а морскому фито- и зоопланктону, при этом подчеркивалась роль диагенеза в перераспределении фосфора. Кроме того, Г. Бушинский придавал большое значение процессам переотложения осадочного материала как условию вторичного обогащения и формирования залежей. Непосредственным источником фосфора в этом процессе он считал речной сток.