Марганцовистые (марганцево-никелево-медная специализация) конкреции котловин формируются на осадочном чехле мощностью до первых сотен метров, представленном (снизу вверх) карбонатными, преимущественно нанофоссилиевыми осадками, тонким (до 1 м) слоем пористого рентгеноаморфного глинистого материала типа аллофона, цеолитсодержащими (красными глубоководными) глинами и иллитовыми глинами.

Венчают разрез конкреции. Глинистая составляющая здесь подобна разрезу глин полного профиля коры выветривания на суше,который, судя по описаниям Н. Страхова и других исследователей, практически не зависит от состава материнских пород, подверженных выветриванию. Все различие заключается только в окислах и вторичных карбонатах металлов. При выветривании карбонатных пород накапливается в основном марганец. Кроме него накапливаются ассоциирующие с ним металлы — молибден, никель, медь и др. В океанических котловинах при гальмиролизе нанофоссилиевых и фораминиферовых осадков также на поверхности глин формируются конкреции с содержанием марганца около 30%, что соизмеримо с его концентрациями в рудах Чнатуры и Никополя.